Des interactions existent entre les êtres vivants et les facteurs physico-chimiques, qu’ils soient climatiques ou liés à la nature du sol.
Par exemple : la nature du sol conditionne la présence de certaines espèces. Pour une même altitude, une même exposition, la présence de fougères n’est observable que sur sol acide.
Inversement, la présence de certaines espèces peut modifier certains facteurs du biotope. Par exemple : une forêt limite la vitesse du vent ou encore les amplitudes thermiques.
Des relations complexes s’établissent donc entre biotope et biocénose.